-
Экспансия нуклеотидных повторов представляет собой патологическое увеличение числа копий коротких нуклеотидных последовательностей ДНК, которые обычно связаны с тяжелыми неврологическими заболеваниями. Эти типы мутаций нестабильны и динамичны, а количество повторов может меняться от поколения к поколению.
-
Состояния, вызываемые экспансией нуклеотидных повторов, клинически и генетически неоднородны и различаются в зависимости от последовательности повтора, размера и местоположения в гене, а также от того, транслируется ли повтор в белок.
-
Анализ экспансии повторов на основе ПЦР является наиболее экономичным методом диагностики заболеваний.
EXP – Экспансия полинуклеотидных повторов
Анализ эспансии полинуклиоидных повторов может быть использован для:
- Диагностики пациента с подозрением на генетическое заболевание, которое может быть вызвано эспансией полинуклиоидных повторов.
- Подтверждения носительства эспансии полинуклиоидных повторов, связанных с аутосомно-рецессивными или Х-сцепленными заболеваниями.
- Пресимптоматическая диагностика родственников из группы риска с заболеваниями с поздним началом, вызванными экспансией повторов.
Некоторые из наиболее распространенных генетических нарушений, обнаруживаемых при Анализе эспансии полинуклиоидных повторов, включают:
- Синдром ломкой Х-хромосомы и связанные с ним состояния
- Атаксия Фридрейха
- Болезнь Хантингтона
- Миотоническая дистрофия 1 и 2 типа
- Спиноцеребеллярная атаксия
В зависимости от типа подозреваемого заболевания могут быть предложены разные типы ПЦР-тестов.
- ПЦР-амплификация, когда нарушения вызваны небольшим количеством повторов (<50 повторов)
- TP-PCR (ПЦР со специализированными праймерами на тринуклеотидные повторы), когда нарушения вызваны большим количеством повторов (> 100 повторов), которые обычная ПЦР не может амплифицировать. Праймеры для амплификации охватывают повтор и включают повторяющуюся последовательность.
Заключения и результаты
Число повторов, диапазоны клинически значимых размеров и закономерности наследования варьируют от заболевания к заболеванию.
- Нормальные аллели:
Аллели с числом повторов, соответствующим нормальному диапазону для этого заболевания, не являются патогенными, и пациент не подвергается повышенному риску развития расстройства в зависимости от способа наследования.
- Премутация:
Аллели с числом повторов, соответствующим диапазону до полной мутации, обычно не являются патогенными, но эти аллели обычно нестабильны и несут риск увеличения повторов до полной патогенной мутации в будущих поколениях.
В зависимости от заболевания и способа наследования у некоторых людей с премутацией могут проявляться симптомы.
- Полные мутации/ вызывающие заболевание аллели:
Аллели с числом повторов, соответствующим полному диапазону мутаций, являются патогенными и могут вызывать генетическое заболевание, в зависимости от заболевания и способа наследования. Возраст начала и тяжесть симптомов могут варьировать в зависимости от количества повторов.
Тип биологического образца
Для пренатальной диагностики:
- Настоятельно рекомендуется заранее связаться с лабораторией, чтобы правильно спланировать взятие образца, сроки выдачи заключения и предвидеть возможные неудобства.
- Образец материнской крови должен быть отправлен со всеми продуктами зачатия, образцами ворсин хориона и амниотической жидкостью.
- Приоритет будет отдан всем пренатальным образцам.
Тщательная маркировка пробирки с уникальной идентификационной информацией является обязательной, неправильная маркировка может привести к отказу от проведения исследования. Минимальная необходимая информация для идентификации и принятия образца: полное имя пациента, дата рождения, пол и номер медицинской карты.
Форма «Информированного согласия» и «Направление на исследование» должны быть должным образом заполнены и подписаны пациентом и врачом.
Ограничения исследования
- Объем этого исследования ограничен анализом экспансии повторов целевого гена и может не выявить точное количество повторов, присутствующих в больших экспансиях.
- Секвенирование генов и анализ делеций/дупликаций не включены в этот анализ, но их можно заказать отдельно.
- Этот анализ не включает исследования метилирования.